Python un gros serpent mais aussi un fantastique langage pour débuter la programmation et manipuler des données biologiques.
Avec Patric Fuchs, nous co-animons un cours d'introduction à Python, destiné aux débutants en programmation mais aussi aux plus chevronnés https://python.sdv.univ-paris-diderot.fr/ (archive HAL) En moyenne, ce site accueille 50 000 visiteurs par mois.
En 2019, nous avons publié ce cours aux éditions Dunod sous le titre « Programmation en Python pour les sciences de la vie ». Afin de promouvoir le partage des connaissances et le logiciel libre, nos droits d'auteurs provenant de la vente de cet ouvrage sont reversés à deux associations. Wikimédia France qui s'occupe notamment de l'encyclopédie libre Wikipédia. NumFOCUS qui soutient le développement de logiciels libres scientifiques et notamment l'écosystème scientifique autour de Python.
Quelques ressources et conseils complémentaires pour apprendre Python :
- Apprendre à programmer avec Python 3 de Gérard Swinnen
- A byte of Python par Swaroop C H
N'hésitez pas à tester votre script Python en ligne avec Online Python Tutor.
Si vous êtes les biologistes, oui, apprendre à programmer est une excellente idée. Voici quelques raisons :
Pour terminer avec une note d'humour, voici pourquoi Python est meilleur que Perl 😇 :
With Yoda strapped to his back, Luke climbs up one of the many thick vines that grow in the swamp until he reaches the Dagobah statistics lab. Panting heavily, he continues his exercises--grepping, installing new packages, logging in as root, and writing replacements for two-year-old shell scripts in Python.
YODA: Code! Yes. A programmer's strength flows from code maintainability. But beware of Perl. Terse syntax... more than one way to do it... default variables. The dark side of code maintainability are they. Easily they flow, quick to join you when code you write. If once you start down the dark path, forever will it dominate your destiny. Consume you it will.
LUKE: Is Perl better than Python?
YODA: No... no... no. Quicker, easier, more seductive.
LUKE: But how will I know why Python is better than Perl?
YODA: You will know. When your code you try to read six months from now.
--- written by: funkster@midwinter.com / source.