Conversion de document avec pandoc :

pandoc -s text.md -o text.html
pandoc -s text.md --mathjax -o text.html
pandoc -s text.md --toc -o text.html
pandoc text.md --latex-engine=xelatex --toc -o text.pdf

Un article sur la manière de rédiger un article scientifique avec Markdown : Formatting Open Science: agilely creating multiple document formats for academic manuscripts with Pandoc Scholar (PeerJ CompSci, 2017).