Avec mes collègues Sophie Sacquin-Mora, Marc Baaden et Florent Barbault nous avons organisé la 17e édition du congrès du Groupe de Graphisme et Modélisation Moléculaire GGMM2011. Je présente ici les outils que nous avons utilisés en interne pour organiser ce congrès et en externe pour communiquer avec les quelques 110 …

Protein blocks are structural prototypes defined by de Brevern et al. [1] (see also references [2] & [3]). Their main interest is to modelize a 3-dimension local structure into a 1-dimension sequence. In principle, any conformation of any amino acid could be represented by one of the sixteen available protein blocks …

Find a common meeting date and time:

• doodle

Free multi-user real-time online editing:

• writeboard, password protection, modifications history
• collabedit, syntax highlighting, easy to use
• ietherpad, mail invitation, authorship colors (see clones as SplinePad, PrimaryPad or TypeWithMe)

Source code comments are also important for efficient team development.

• pydoc for Python scripts …

Les dernières versions de mes cours Introduction à la programmation et Formats de données en biologie sont disponibles en ligne.

Introduction à la programmation

Formats de données en biologie

Here is a bash script that reduces the size of a PDF file provided as an argument.

 1
 2
 3
 4
 5
 6
 7
 8
 9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28

#! /bin/bash
# PP 29/08 …